ROOT CERN¶

简介¶

CERN ROOT，简称ROOT，是一个由欧洲核子研究组织（CERN）开发的开源软件框架，专为高能物理实验数据分析设计。ROOT的核心是模块化设计，提供了包括输入输出、数据分析框架、图形用户界面、统计分析工具和网络服务在内的多种功能组件。它能够高效处理大数据，包含统计分析、可视化工具，并支持与其他编程语言如Python和R的集成。ROOT的文件格式特别适合存储和处理大规模数据集。ROOT在科学研究领域扮演着关键角色，尤其是在粒子物理学中。

安装环境¶

使用方法¶

1. 集群1

   # 申请资源
   salloc -N 1 -p cpuXeon6458 -t 60:00 --cpus-per-task=32
   # 登录到计算节点
   ssh -Y <主机名>
   # 激活环境
   module load singularity
   # 启动容器，并自动进入容器环境（shell）
   singularity shell /share/install_packages/singularity/root-cern-noroot.sif
   # 激活容器内root的环境变量
   source /opt/root_install/bin/thisroot.sh
   # 软件启动
   root
   

2. 集群2

   # 申请资源
   salloc -N 1 -p cpuXeon6458 -t 60:00 --cpus-per-task=32 -x comput[185-196]
   # 登录到计算节点
   ssh -Y <主机名>
   # 激活环境
   module load apps/singularity
   # 启动容器，并自动进入容器环境（shell）
   singularity shell /public/software/software-docker/images/root-cern-noroot.sif
   # 激活容器内root的环境变量
   source /opt/root_install/bin/thisroot.sh
   # 软件启动
   root
   

编译指导¶

1. 参考以下内容创建root-cern.def文件

   Bootstrap: docker
   From: centos:8
   
   %post
   
       sed -i -e "s|mirrorlist=|#mirrorlist=|g" /etc/yum.repos.d/CentOS-*
       sed -i -e "s|#baseurl=http://mirror.centos.org|baseurl=http://vault.centos.org|g" /etc/yum.repos.d/CentOS-*
   
       yum install git make cmake gcc-c++ gcc binutils \
           libX11-devel libXpm-devel libXft-devel libXext-devel openssl-devel  python39 -y
   
       # 下载并安装ROOT（最新版本）
       cd /opt
       git clone --branch latest-stable --depth=1 https://github.com/root-project/root.git root_src
       mkdir root_build root_install && cd root_build
       cmake -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=../root_install ../root_src
       cmake --build . -- install -j10 # -j10为10个核心同时编译，按需改或直接删掉用单核心编译
       rm -rf /opt/root_build /opt/root_src
   

2. 激活singularity 并进行编译

   # 集群2（选择对应集群执行，二选一）
   module load apps/singularity
   # 集群1（选择对应集群执行，二选一）
   module load singularity
   # 进行编译，时间可能会比较久
   singularity build --fakeroot root-cern.sif root-cern.def
   

参考资料¶

root-cern 依赖关系

root-cern 源码编译指导

singularity 使用方法

Contributor：rkwu